办公室（党委办公室）  

　　主要职责：承担机关日常运转，承担文秘、信息调研、政务公开、政府信息公开、税收宣传、会务管理、来信来访、机要保密、档案管理、督查督办等工作。 

　　法制股  

　　主要职责：落实依法行政工作；承担涉及多个税种、社会保险费和非税收入综合性政策文件的会办和落实工作；承担规范性文件合法性审查、合规性评估、备案审查、清理等工作；承担重大执法决定的法制审核工作；组织实施重大税务案件审理工作；组织办理行政复议、行政诉讼、行政赔偿等工作。 

　　税政股  

　　主要职责：组织落实税收优惠政策；承担增值税发票管理，组织相关信息系统的推广应用及管理；承办出口货物退（免）税的审核上报工作；组织实施企业所得税的季（月）度预征、汇算清缴等工作；组织实施个人所得税源泉扣缴、自行申报、汇算清缴、事后抽查等工作。 

　　社会保险费和非税收入股  

　　主要职责：落实基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费征收管理工作和文化事业建设费、教育费附加和地方教育附加等有关非税收入的征收管理工作。 

　　纳税服务股  

　　主要职责：落实纳税服务制度和规范；承担税法宣传、纳税辅导、咨询服务、办税服务和权益保护等工作；承担办税服务厅、纳税服务热线等面向纳税人和缴费人的服务渠道管理；承担税收信用体系建设。 

　　征收管理股  

　　主要职责：组织落实综合性税收征管法律、法规、规章及规范性文件；承担税务登记、纳税申报、普通发票管理等征管工作；承担征管质量监控评价；组织实施信息化建设工作。 

　　收入核算股  

　　主要职责：实施税收、社会保险费和有关非税收入预算目标；落实税收、社会保险费和非税收入的预算目标任务；统筹协调组织收入工作，开展收入预测分析、预警分析和收入质量管理工作；办理出口退（免）税、免抵调库工作；承担会统核算、缴库退库等工作，实施会计监督。 

　　税源管理股  

　　主要职责：承担税收、社会保险费和有关非税收入的基础事项管理及其风险应对工作；承担出口退（免）税、国际税收、非居民企业等依据纳税人分类分级管理确定为特定业务纳税人的特定事项办理；贯彻执行税收法律、法规和各项税费政策；承担信息采集；承担税费清算工作；承办纳税信用评价工作。 

　　风险管理股  

　　主要职责：组织落实税收风险管理工作；承担风险应对任务的统筹、推送、监控评价、结果反馈等工作；承办基础管理风险以外各类风险应对任务工作；承办反避税调查、特别纳税调整调查工作。

　　组织人事股  

　　主要职责：组织落实干部人事制度及税务人才队伍建设；承担人事、机构编制、公务员管理、干部考核等工作。 

　　机关党委（党建工作股）  

　　主要职责：协助焉耆县税务局党委落实全面从严治党主体责任；宣传和执行党的路线方针政策；统筹本系统思想政治建设、意识形态建设、税务文化建设、精神文明建设和统战工作；组织和指导系统巡察工作。

　　党委纪检组

　　主要职责：负责机关和派出机构党的纪律检查工作。